Στο Όλυμπο υπάρχουν 1700 είδη και υποείδη που αντιστοιχούν στο 25% της μεσογειακής χλωρίδας. Από αυτά τα 187 χαρακτηρίζονται σημαντικά για τον άνθρωπο, 56 ενδημικά και 23 τοπικά ενδημικά, ενώ 16 από αυτά χαρακτηρίζονται σπάνια.

Με έντονη ποικιλότητα ανάγλυφου, διαφορετικό προσανατολισμό των πλαγιών κάθε θέση του σε σχέση με τη θάλασσα επηρεάζει κατα τόπους το κλίμα και έχει σαν αποτέλεσμα την επικράτηση ενός μικροκλίματος που σε συνδυασμό με το γεωλογικό υπόβαθρο βοηθά την ανάπτυξη ιδιαίτερων τύπων βλάστησης και βοτάνων.